MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 7826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007181	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007181	TA	3	6	1633	1638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007181	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007181	AT	3	6	3789	3794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007181	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007181	T	7	7	4131	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007181	AT	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007181	CTAA	2	8	4442	4449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007181	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007181	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007181	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007181	ATA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007181	CTAT	2	8	8255	8262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007181	TA	3	6	8263	8268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007181	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007181	T	6	6	8334	8339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007181	TAC	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007181	ATT	2	6	10146	10151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007181	GT	3	6	10153	10158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007181	ATA	2	6	10166	10171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007181	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007181	ATA	2	6	12176	12181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007181	TA	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007181	GAT	2	6	12239	12244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007181	ATA	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007181	TTAG	2	8	18425	18432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007181	AAT	2	6	19960	19965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007181	AT	4	8	19964	19971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007181	ACT	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007181	T	6	6	22923	22928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007181	A	6	6	24186	24191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007181	AACG	2	8	24211	24218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007181	TGA	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007181	CATA	2	8	24479	24486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007181	TAT	2	6	24490	24495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007181	A	6	6	25586	25591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007181	TGTT	2	8	25592	25599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007181	CATAAA	2	12	28053	28064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007181	ATA	2	6	28065	28070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007181	AAAT	2	8	29445	29452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007181	ATT	2	6	29482	29487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007181	ATT	2	6	29495	29500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007181	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007181	TAA	2	6	29532	29537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007181	CATAA	2	10	29592	29601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007181	TAT	2	6	29602	29607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007181	T	6	6	30109	30114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007181	T	6	6	30128	30133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007181	CTT	2	6	32193	32198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007181	ATT	2	6	32252	32257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007181	T	6	6	32261	32266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007181	ACTC	2	8	32302	32309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007181	ATGA	2	8	32331	32338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007181	TA	3	6	33703	33708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007181	ATT	2	6	33729	33734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007181	T	7	7	33733	33739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007181	ATT	2	6	33753	33758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007181	AAT	2	6	33764	33769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007181	ATA	2	6	33795	33800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007181	ATA	2	6	33813	33818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007181	T	6	6	33867	33872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007181	AT	3	6	33873	33878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007181	AAC	2	6	33882	33887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007181	AT	4	8	33913	33920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007181	AT	3	6	33943	33948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007181	A	6	6	33971	33976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007181	A	6	6	34005	34010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007181	ATT	2	6	34093	34098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007181	ATTC	2	8	34119	34126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007181	GTA	2	6	34176	34181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007181	TA	3	6	34208	34213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007181	ATT	2	6	34766	34771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007181	TTA	2	6	41071	41076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007181	TA	3	6	41095	41100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007181	TAT	2	6	41107	41112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007181	A	7	7	41153	41159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007181	T	6	6	41599	41604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007181	CAA	2	6	41636	41641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007181	A	6	6	41680	41685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007181	ATG	2	6	42139	42144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007181	ATG	2	6	42165	42170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007181	AT	3	6	44210	44215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007181	T	6	6	48024	48029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007181	GCC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007181	ACC	2	6	48060	48065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007181	CTAG	2	8	48119	48126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007181	TTA	2	6	48135	48140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007181	TTG	2	6	48143	48148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007181	ATT	2	6	48267	48272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007181	TA	3	6	48303	48308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007181	AAT	2	6	48314	48319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007181	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007181	TTTA	2	8	48363	48370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007181	TTA	2	6	48656	48661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007181	TACT	2	8	48696	48703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007181	AT	3	6	48706	48711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007181	TGA	2	6	49079	49084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007181	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007181	AAT	2	6	49156	49161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007181	ACC	2	6	49187	49192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_007181	TC	3	6	49196	49201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007181	ATC	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007181	CAA	2	6	49223	49228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007181	ATC	2	6	49302	49307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007181	TAGA	2	8	49329	49336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007181	ATA	2	6	51967	51972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007181	TTTA	2	8	55657	55664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007181	TAG	2	6	55670	55675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007181	A	6	6	60371	60376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007181	A	6	6	60393	60398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007181	AGT	2	6	60781	60786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007181	A	6	6	60787	60792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007181	ATT	2	6	61223	61228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007181	GTA	2	6	64795	64800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007181	TA	3	6	68459	68464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007181	TTTCTC	2	12	68512	68523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007181	AGA	3	9	68553	68561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007181	TA	3	6	72152	72157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007181	ATT	2	6	72161	72166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007181	ATC	2	6	72282	72287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007181	GGAG	2	8	72324	72331	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007181	TCG	2	6	72402	72407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007181	AGG	2	6	72417	72422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007181	ATTT	2	8	72476	72483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007181	GTTCAT	2	12	72503	72514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007181	ATA	2	6	72560	72565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007181	CG	3	6	72595	72600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007181	CTAA	2	8	72736	72743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007181	TAA	2	6	72790	72795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007181	TCA	2	6	72796	72801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007181	ATT	2	6	72839	72844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007181	T	6	6	72843	72848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007181	TCA	2	6	72874	72879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007181	A	7	7	72888	72894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007181	TTA	2	6	72896	72901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007181	T	6	6	75999	76004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007181	AAAT	2	8	76747	76754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007181	ATA	2	6	76766	76771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007181	ATA	2	6	76956	76961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007181	ATA	2	6	76970	76975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007181	TAA	2	6	77035	77040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007181	T	6	6	77052	77057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007181	T	6	6	77062	77067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007181	A	7	7	77134	77140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007181	TAAA	2	8	80444	80451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007181	A	7	7	80467	80473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007181	CTT	2	6	80984	80989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007181	TAA	2	6	81018	81023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007181	AT	3	6	81105	81110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007181	A	6	6	81114	81119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_007181	CTT	2	6	129985	129990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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